图神经网络 (GNN) 简介:概念、类型和用途

来源:小Z的科研日常


图神经网络(GNN)是一种专门设计用于处理图结构数据的神经网络。图是通用的数据结构,可以表示从社交网络和分子结构到句子和知识库的任何内容。本文将对 GNN 基本组件和概念进行介绍:


图的组成部分:

1.节点:代表实体或者对象,

2. 边 :它们表示节点之间的逻辑关系。


GNN中的关键概念:

1. 消息传递:GNN 通过在图中的节点之间传播信息来进行操作。每个节点根据其当前状态(特征)向其邻居发送一条“消息”。

2. 节点表示:GNN 旨在学习图中每个节点的高维表示(嵌入),捕获节点在整个图结构中的位置、邻域和角色。

3. 聚合功能:GNN 中的一个基本概念是从相邻节点接收到的消息或信息的聚合。流行的聚合函数包括平均值、总和和最大值。

4. 更新规则:聚合的消息与节点自身的表示相结合,用于更新节点的状态或特征。

5. 多层:与传统神经网络类似,GNN 可以具有多层,允许在图中更广泛的范围内传播和聚合信息。


图神经网络的类型:

1. 图卷积网络(GCN):一种流行的 GNN 类型,其中图卷积运算用于消息传递。

2. GraphSAGE:一种可扩展的方法,通过采样和聚合节点本地邻域的特征来学习嵌入。

3. 图注意力网络(GAT):这些网络结合了注意力机制来不同地权衡相邻节点的影响。


GNN 的应用

图神经网络(GNN)利用其直接处理图结构数据的能力,在各个领域拥有广泛的应用。

1. 节点分类

目标:在节点分类中,目标是根据关系结构和属性信息为图中的各个节点分配标签。

用例:

  • 社交网络:识别用户可能所属的潜在角色或群体,例如识别影响者或根据兴趣对用户进行分类。
  • 生物网络:预测蛋白质-蛋白质相互作用网络中蛋白质的功能。

2. 图分类:

目标:在此任务中,GNN 用于预测整个图或子图的标签。

用例:

  • 分子分析:确定化合物是否可能对疾病具有活性。
  • 社交网络:根据结构属性对整个网络进行分类。

3. 链接预测

目标:这涉及预测图中两个节点之间存在链接的可能性,该链接可以表示关系或交互。

用例:

  • 推荐系统:根据用户过去的交互来预测用户可能交互的项目。
  • 知识图:推断实体之间缺失的关系或预测未来的关系。

4. 推荐系统

目标:GNN 用于通过处理表示用户-项目交互的图结构数据来向用户推荐项目。

用例:

  • 电子商务:根据客户过去的互动以及类似用户的互动向客户推荐产品。
  • 电影推荐:根据用户过去的观看历史和喜好向他们推荐电影。


使用 GNN 的热门库:

1. PyTorch Geometric:一个基于 PyTorch 的库,可简化图形数据的处理。

2. Deep Graph Library (DGL):另一个流行的库,支持各种 GNN 模型,并在 PyTorch 和 MXNet 中拥有后端。

研究或工业中的示例用例:

1. 生物信息学: GNN 已在生物信息学中用于预测蛋白质功能和相互作用。

2. 社交网络分析:他们可以对社交网络进行分析和预测,例如好友推荐。


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